По-перше, біогумус можна використовувати як звичайне органічне добриво в дозах 3-6 т/га, витримуючи в іншому рекомендації щодо застосування гною. Найчастіше біогумус застосовують при вирощуванні овочевих культур у теплицях. Так, приріст урожаю огірків та помідорів у тепличних ділянках, при використанні біогумусу як добрива, в середньому становить 30–35% та 30–40% відповідно. Оптимальна доза біогумусу при вирощуванні картоплі – 6 т/га, а на чорноземах – 2 т/га. Приріст урожаю – 30–45%. Значно підвищується і вміст крохмалю у бульбах. При вирощуванні садових суниць врожайність збільшується на 50-60%.
Однак, враховуючи чималу вартість біогумусу в торговельній мережі, доцільніше вибрати інші прийоми його використання. Наприклад, хороший ефект отримують при використанні біогумусу для замочування насіння. З цією метою наполягають протягом доби завис добрива у воді (співвідношення 1:5). Рідина при цьому набуває кольору міцного чаю. Замочене в такому настої насіння дає дружне проростання, набуває стійкості до захворювань, помітно випереджають у рості ті рослини, насіння яких було замочено в чистій воді.